gatk --java-options -Xmx14g ApplyBQSR -R Gallus_gallus.Gallus_gallus-5.0.dna.toplevel_chr25-26.fa --input SRR7062654.md.bam --output SRR7062654.md.recal.bam --bqsr-recal-file SRR7062654.md.recal.table
gatk --java-options -Xmx14g ApplyBQSR -R Gallus_gallus.Gallus_gallus-5.0.dna.toplevel_chr25-26.fa --input SRR7062655.md.bam --output SRR7062655.md.recal.bam --bqsr-recal-file SRR7062655.md.recal.table