FastQCFastQC Report
lun. 25 juil. 2022
SRR18726953_1.30x.fastq

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameSRR18726953_1.30x.fastq
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48000
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length1000-95047
%GC34

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATA40988.537500000000001No Hit
TGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAG28725.983333333333333No Hit
ATTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT18363.8249999999999997No Hit
ATGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATA9581.9958333333333336No Hit
GTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATA9561.9916666666666667No Hit
GTATGCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATA8661.8041666666666667No Hit
GTTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT5191.0812499999999998No Hit
AGTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT5151.0729166666666667No Hit
GTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAGA5131.06875No Hit
TTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGAAACACGATAG2950.6145833333333333No Hit
GTATACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATA2840.5916666666666667No Hit
TGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGAAACACGATAGA2780.5791666666666666No Hit
GTAATACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT2540.5291666666666667No Hit
TATGCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAG2380.49583333333333335No Hit
GTATTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT2330.4854166666666666No Hit
GATGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT2280.475No Hit
ATCATGCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT2090.4354166666666667No Hit
AATGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT1680.35000000000000003No Hit
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT1650.34375No Hit
TATTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATA1550.3229166666666667No Hit
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA1500.3125No Hit
TACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAGAA1450.3020833333333333No Hit
ATCTTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACG1330.27708333333333335No Hit
ATTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGAAACACGATA1180.24583333333333332No Hit
TTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGGAAACACGAT1170.24375No Hit
TTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATG1150.23958333333333331No Hit
ATCATACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT1070.22291666666666665No Hit
ATCTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGA1070.22291666666666665No Hit
ATGCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAGA1020.21250000000000002No Hit
ATGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGAAACACGATAG910.18958333333333333No Hit
ATGTGCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATA900.1875No Hit
TATACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAG880.18333333333333332No Hit
TGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGGAAACACGATA820.17083333333333334No Hit
AATTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGA770.16041666666666668No Hit
TTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACATTA770.16041666666666668No Hit
GTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGAAACACGATAG740.15416666666666667No Hit
TTGTGCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATA730.15208333333333332No Hit
GTATGCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGAAACACGATAG720.15No Hit
TGCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAGAA710.14791666666666667No Hit
TGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAA680.14166666666666666No Hit
GTAATGCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT670.13958333333333334No Hit
AACGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT640.13333333333333333No Hit
ATACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAGA640.13333333333333333No Hit
TTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTACTAAGGTTAATAGGGAAACACGATA640.13333333333333333No Hit
ATCGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT570.11875No Hit
TTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGAAACACGATAGA560.11666666666666668No Hit
CGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAG560.11666666666666668No Hit
TGTGCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAG560.11666666666666668No Hit
GTAGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT560.11666666666666668No Hit
TGTACTTCGTTCGGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAG530.11041666666666668No Hit
ATTGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGGAAACACGA530.11041666666666668No Hit
TGTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATGA530.11041666666666668No Hit
GTATTGCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT530.11041666666666668No Hit
AGTATGCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGAT520.10833333333333332No Hit
TTGCTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAGA510.10625000000000001No Hit
ATTACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAATAGGGAAACACGATAG510.10625000000000001No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.7)